UD Bawang Tobing merupakan perusahaan yang bergerak di bidang penjualan bahan baku pangan seperti bawang merah, bawang putih, cabai kering, dan kemiri. Permasalahan utama yang dihadapi adalah pencatatan transaksi dan laporan keuangan yang masih dilakukan secara manual, sehingga rawan terjadi kesalahan dan keterlambatan informasi. Penelitian ini bertujuan untuk merancang dan membangun sistem informasi akuntansi berbasis Website menggunakan metode Prototyping agar sistem yang dikembangkan sesuai dengan kebutuhan pengguna. Sistem dibangun menggunakan Framework Codeigniter dan Database MySQL yang mendukung pengelolaan transaksi, laporan keuangan (laba rugi, neraca, dan perubahan modal), serta persediaan barang dengan metode average. Metode Prototyping dilakukan melalui dua iterasi pengembangan pada Januari dan April 2025, dengan penyesuaian sistem berdasarkan masukan langsung dari pengguna. Pengujian Black Box menunjukkan seluruh fitur sistem berfungsi sebagaimana mestinya. Usability Testing menunjukkan bahwa antarmuka sistem mudah digunakan dan mendukung efisiensi kerja. Validasi oleh praktisi akuntansi membuktikan bahwa laporan keuangan yang dihasilkan akurat dan sesuai dengan standar akuntansi. Sistem ini mempermudah pencatatan transaksi, menghitung harga pokok secara otomatis, dan menyajikan laporan keuangan secara real-time, menggantikan metode manual yang kurang efisien.