Ilmu Pengetahuan Alam (IPA) merupakan mata pelajaran yang mempelajari proses alam secara terstruktur, salah satunya materi sistem gerak manusia yang mencakup rangka, sendi, otot, dan sistem saraf. Berdasarkan hasil wawancara dengan guru kelas 6 SDN 102 Pekanbaru, siswa mengalami kesulitan memahami materi sistem gerak karena metode pembelajaran konvensional dan keterbatasan media visual. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan media pembelajaran berbasis Marker-Based Augmented Reality (AR) 3D yang dilengkapi dengan animasi, narasi audio, serta kuis interaktif untuk meningkatkan pemahaman siswa. Pengembangan aplikasi menggunakan perangkat lunak Blender, Unity, dan Vuforia SDK dengan menerapkan tahapan pengembangan multimedia dan menggunakan metode metode Multimedia Development Life Cycle (MDLC) yang terdiri dari alur pra-produksi (concept dan design), produksi (material collecting dan assembly), serta pasca-produksi (testing dan distribution). Evaluasi aplikasi dilakukan secara komprehensif melalui pengujian fungsionalitas, pengujian kelayakan, usability, dampak pembelajaran, dan performa teknis AR. Hasil pengujian fungsionalitas (Black Box Testing) dan User Acceptance Testing (UAT) menunjukkan seluruh fitur aplikasi berhasil berfungsi 100%. Hasil aplikasi ini mempermudah pengujian keakuratan materi sistem gerak oleh ahli medis (dokter ortopedi) dan pengujian kesesuaian konten pembelajaran oleh guru menyatakan materi akurat serta sangat sesuai dengan kurikulum. Pengujian usability (System Usability Scale - SUS) oleh siswa memperoleh skor 79,1 yang masuk dalam kategori "Good" (layak). Evaluasi pemahaman menunjukkan adanya peningkatan rata-rata nilai siswa dari pre-test ke post-test. Pengujian teknis AR membuktikan kamera mampu mendeteksi marker dan menampilkan objek 3D secara stabil pada berbagai variasi sudut, jarak, serta kondisi pencahayaan. Media pembelajaran berbasis AR ini dinyatakan layak dan efektif digunakan dalam mendukung proses pembelajaran sistem gerak manusia.