Pengembangan sistem kontrol pada mesin pembuat biodiesel berbahan minyak jelantah dilakukan untuk meningkatkan efisiensi proses produksi biodiesel, khususnya pada proses pendinginan reaktor dan pemisahan Fatty Acid Methyl Ester (FAME) dari gliserol. Penelitian terdahulu melakukan pendinginan minyak pada volume 5 dan 10 liter hingga suhu 40°C dengan waktu 5–6 menit. Penelitian ini mengembangkan sistem kontrol berbasis Arduino Mega dengan variasi volume 2, 4, dan 6 liter serta target suhu pendinginan 45°C. Sistem menggunakan sensor suhu DS18B20, sensor ultrasonik HC-SR04, Variable Frequency Drive (VFD), dan LCD sebagai media monitoring. Hasil pengujian menunjukkan waktu pendinginan 4–5 menit untuk 2 liter, 6–7 menit untuk 4 liter, dan 10–12 menit untuk 6 liter. Selain itu, sistem mampu mengendalikan proses pemanasan hingga 65°C, pengisian minyak secara otomatis, serta mengoperasikan mesin sentrifugal selama 5 menit. Pengujian VFD pada frekuensi 8 Hz, 10 Hz, dan 12 Hz menunjukkan bahwa kecepatan motor dapat diatur sesuai hasil perhitungan dan pengukuran tachometer. Dengan demikian, penelitian ini menghasilkan pengembangan pada sistem sebelumnya melalui penambahan kontrol otomatis pada proses pendinginan dan pemisahan biodiesel.